Protein–RNA interactions for Protein: Q9GZP0

PDGFD, Platelet-derived growth factor D, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 370 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDGFDQ9GZP0 AC008406.1-201ENST00000509530 541 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC005865.1-202ENST00000543036 641 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 NAT9-220ENST00000582870 896 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 BX537318.1-201ENST00000608290 1207 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PRSS45-202ENST00000620911 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC008878.3-201ENST00000617428 4964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AGER-201ENST00000375055 1369 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ADAMTSL1-204ENST00000380545 1562 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ALOX12P2-203ENST00000570921 1945 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 RNF165-205ENST00000588679 2904 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL357373.1-201ENST00000394974 322 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL592076.1-201ENST00000424448 303 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 KRT17P4-201ENST00000429445 819 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL157788.1-201ENST00000437838 229 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC004837.1-201ENST00000446267 564 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 LINC00634-202ENST00000505157 222 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 POLD4-208ENST00000532830 904 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 BCL2L12-204ENST00000594157 620 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MIA-206ENST00000597784 455 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PSMD5-208ENST00000625444 219 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FAM180B-201ENST00000538490 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 OSER1-201ENST00000255174 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 SPAG8-209ENST00000484764 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MSI2-206ENST00000579180 1635 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC244394.1-201ENST00000435000 1665 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 SLC25A45-208ENST00000527174 2138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 SNX14-215ENST00000513865 2259 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 NSFL1C-202ENST00000353088 2611 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FSTL1-201ENST00000295633 5943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ACSS3-201ENST00000261206 2666 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 XRCC3-201ENST00000352127 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 PSMD12-202ENST00000357146 2437 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC015909.3-201ENST00000572855 1794 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 ASB10-204ENST00000420175 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 CTSW-204ENST00000528419 1341 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 INS-IGF2-202ENST00000397270 828 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC096649.1-201ENST00000449168 497 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AL132639.2-202ENST00000553520 467 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AC012645.2-201ENST00000566190 553 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 GFER-204ENST00000567719 483 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MIR3180-2-201ENST00000581748 88 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 SPINT2-204ENST00000587090 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MIR6769A-201ENST00000617340 73 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 MME-218ENST00000625667 363 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FAM69C-201ENST00000343998 3671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PDGFDQ9GZP0 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.4 ms