Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXJ4

C1QTNF3, Complement C1q tumor necrosis factor-related protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 246 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C1QTNF3Q9BXJ4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
C1QTNF3Q9BXJ4 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 MUC20-201ENST00000320736 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 C1QTNF1-212ENST00000583904 1129 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CTSB-219ENST00000530640 1389 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AEN-201ENST00000332810 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC068946.1-202ENST00000318673 2745 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 MAPT-213ENST00000571987 2277 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 HHATL-AS1-201ENST00000423165 557 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 PFN2-205ENST00000461868 613 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RHBDL2-203ENST00000540558 697 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 BTD-207ENST00000449107 1820 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 DMTN-206ENST00000443491 2415 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 HTR3A-202ENST00000355556 2331 ntTSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
C1QTNF3Q9BXJ4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.5 ms