Protein–RNA interactions for Protein: Q9BW71

HIRIP3, HIRA-interacting protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 556 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIRIP3Q9BW71 SMIM22-202ENST00000586440 549 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TXNL4A-212ENST00000592957 546 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC008735.3-201ENST00000596646 500 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LINC01215-201ENST00000607746 2592 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ARHGAP11A-201ENST00000361627 5898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 LMNA-203ENST00000368297 1679 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PROZ-202ENST00000375547 1488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NDUFB7-201ENST00000215565 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GGTLC2-202ENST00000448514 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TSPAN11-204ENST00000546076 1058 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC087612.1-201ENST00000560238 658 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 H2BFM-203ENST00000598335 465 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MFSD4A-207ENST00000536357 1841 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ASNS-201ENST00000175506 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 BUD31-201ENST00000222969 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 FO393414.2-201ENST00000405153 598 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL034550.1-201ENST00000442179 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC022494.1-201ENST00000466044 728 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 STAU2-219ENST00000522509 2173 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 SOD1-201ENST00000270142 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
HIRIP3Q9BW71 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms