Protein–RNA interactions for Protein: Q96JM4

LRRIQ1, Leucine-rich repeat and IQ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,722 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRIQ1Q96JM4 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 DKFZP434H168-201ENST00000567381 1905 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 VDAC1P1-201ENST00000439229 848 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 MEG3_2.1-201ENST00000611456 105 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 YRDCP1-201ENST00000621419 643 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
LRRIQ1Q96JM4 TANGO2-205ENST00000401886 1559 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 B9D1-202ENST00000268841 755 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CAMKMT-203ENST00000403853 1114 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL121901.1-201ENST00000419613 366 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC106794.1-201ENST00000506935 792 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CDC42-203ENST00000400259 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DDX19A-202ENST00000417604 1703 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DMTN-223ENST00000523782 2235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PARVG-206ENST00000444313 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 RANBP1-201ENST00000331821 837 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC079807.2-203ENST00000417692 656 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 VAMP8-203ENST00000432071 664 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AP001043.1-205ENST00000623098 1033 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 CCDC51-202ENST00000412398 1385 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC02028-203ENST00000443776 453 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 LINC01848-201ENST00000523446 518 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 COG4-212ENST00000564653 590 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC244452.3-201ENST00000636814 210 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TBXAS1-208ENST00000448866 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AP4M1-205ENST00000422582 1814 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AL137783.1-201ENST00000623494 1896 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 FRMD3-202ENST00000328788 964 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 DMAC2-203ENST00000417807 1065 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC23.49■■□□□ 1.35
LRRIQ1Q96JM4 GUSBP1-202ENST00000508260 1012 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
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