Protein–RNA interactions for Protein: Q969T4

UBE2E3, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 E3, humanhuman

Predictions only

Length 207 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2E3Q969T4 TIMM17BP1-201ENST00000545713 516 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 RDM1-227ENST00000619876 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ANKRD33-201ENST00000301190 1935 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 HYAL1-201ENST00000266031 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 C18orf15-201ENST00000623680 2534 ntBASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PAK2-201ENST00000327134 6139 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 UCP2-201ENST00000310473 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PAK1-210ENST00000528203 1878 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PHYH-203ENST00000396920 1829 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 G6PD-203ENST00000393564 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 H3F3C-201ENST00000340398 1057 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 TMEM37-202ENST00000409826 794 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PIGZ-204ENST00000443835 675 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC006001.2-201ENST00000448096 393 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ZFP30-201ENST00000351218 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 RASD2-201ENST00000216127 3412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 GHDC-207ENST00000587427 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 LAPTM4A-201ENST00000175091 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 AFTPH-201ENST00000238855 4113 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MAGEA2-202ENST00000598543 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 HSD17B6-206ENST00000555159 1525 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 OTULIN-201ENST00000284274 7800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 MYCBPAP-201ENST00000323776 3186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 IL12RB2-201ENST00000262345 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
UBE2E3Q969T4 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.7 ms