Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 OTUD6A-201ENST00000338352 1689 ntAPPRIS P1 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF281-203ENST00000367353 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SNHG1-213ENST00000540725 1374 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 RPL35-201ENST00000348462 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 BEX2-201ENST00000372674 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ARL16-201ENST00000397498 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00642-202ENST00000442515 670 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ARL16-214ENST00000621051 1181 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 RPL35-206ENST00000629845 340 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35G5-201ENST00000382435 1321 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MPV17-201ENST00000233545 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC245369.1-201ENST00000390634 434 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AL136361.1-201ENST00000435429 506 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TAPBP-241ENST00000489157 1299 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AP006333.2-201ENST00000544948 732 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MIR4754-201ENST00000582477 89 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC008763.2-203ENST00000595866 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MUC1-226ENST00000614519 1093 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PCBP2-202ENST00000359462 1814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 C21orf33-201ENST00000291577 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A7P-201ENST00000382628 1395 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 FAM90A23P-201ENST00000400136 1395 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TMSB10-201ENST00000233143 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PRKRA-211ENST00000487082 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CARHSP1-203ENST00000561530 729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AL157813.1-201ENST00000612996 587 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 FAM120AOS-201ENST00000375412 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC092978.1-201ENST00000474979 1309 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC092978.1-202ENST00000637590 1327 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 OXA1L-201ENST00000285848 1719 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MBLAC2-202ENST00000514906 1936 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 APRT-201ENST00000378364 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SERPINE3-201ENST00000400389 1218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TUBB8P8-201ENST00000458717 1058 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AL928654.3-201ENST00000552675 445 ntTSL 3 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PMP22-201ENST00000312280 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SEC14L4-201ENST00000255858 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 PCOLCE-201ENST00000223061 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 VCPKMT-201ENST00000395859 795 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 RPL17P11-201ENST00000417593 544 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 SEC23A-204ENST00000548032 907 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 MAX-211ENST00000555667 574 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 STUB1-204ENST00000564370 875 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 AC127024.2-201ENST00000581019 789 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
CTTNBP2Q8WZ74 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.8 ms