Protein–RNA interactions for Protein: Q8N474

SFRP1, Secreted frizzled-related protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFRP1Q8N474 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NUDT16-203ENST00000537561 5943 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PIP4K2A-206ENST00000545335 1436 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DFFBP1-201ENST00000433250 979 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC099482.1-201ENST00000563471 481 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC025048.3-201ENST00000590609 569 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC004790.1-201ENST00000612686 536 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC26A5-202ENST00000339444 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SNHG22-201ENST00000589499 1615 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MAU2-201ENST00000262815 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 INPPL1-207ENST00000538751 4656 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SEMA4F-201ENST00000339773 2177 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 DHX40-202ENST00000425628 2255 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 C3orf67-201ENST00000295966 2650 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SLC25A37-206ENST00000519973 4823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ATG9B-212ENST00000639579 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 MDH2-205ENST00000461263 648 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 PSEN2-206ENST00000472139 1163 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 Metazoa_SRP.112-201ENST00000613101 279 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 WIZ-206ENST00000599686 3644 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
SFRP1Q8N474 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
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