Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXF0

NPAS3, Neuronal PAS domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 933 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NPAS3Q8IXF0 RPL27A-202ENST00000524496 558 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 EEF1DP1-201ENST00000585891 896 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 GRIA4-203ENST00000393127 5621 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-201ENST00000218224 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-202ENST00000247140 664 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-203ENST00000376563 1056 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-204ENST00000376566 760 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-205ENST00000396763 965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CALR4P-201ENST00000431943 946 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PQBP1-207ENST00000447146 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AL160290.2-201ENST00000448347 831 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC006003.1-201ENST00000448541 613 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HOMER2P2-201ENST00000451621 847 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LAMA5-AS1-203ENST00000478167 690 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC006487.1-201ENST00000514506 1221 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DIO3OS-203ENST00000554441 1068 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 GRN-222ENST00000639447 1314 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LAD1-201ENST00000367313 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SART1-201ENST00000312397 3293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 HSPB7-204ENST00000411503 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SMIM11A-203ENST00000399299 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CDKN2AIP-205ENST00000510928 860 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AP000439.4-201ENST00000567742 664 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 TGFB1I1-203ENST00000394863 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NPAS3Q8IXF0 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.5 ms