Protein–RNA interactions for Protein: Q76N89

HECW1, E3 ubiquitin-protein ligase HECW1, humanhuman

Predictions only

Length 1,606 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HECW1Q76N89 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 HMGN3-201ENST00000275036 831 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 HMGN3-202ENST00000344726 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RNMTL1P1-201ENST00000454103 560 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ZNF419-208ENST00000518999 746 ntTSL 3 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC024681.1-201ENST00000521917 487 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DHRS7C-202ENST00000571134 984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 C1QTNF1-AS1-202ENST00000581579 865 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC068587.8-201ENST00000641239 219 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 IGHA2-202ENST00000497872 1320 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CRELD1-203ENST00000397170 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 IGF1-201ENST00000307046 1097 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 IGF1-203ENST00000392904 761 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC005740.2-201ENST00000511085 419 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CDK4-201ENST00000257904 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RFPL2-203ENST00000400237 2407 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TTYH3-201ENST00000258796 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RDH5-201ENST00000257895 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MPV17-204ENST00000399052 749 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CDC23-208ENST00000505120 455 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FAM86B1-218ENST00000534520 808 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RDH5-204ENST00000548082 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AF254983.2-201ENST00000612331 135 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC239802.2-201ENST00000532137 554 ntTSL 4 BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC018635.2-201ENST00000608625 364 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TBX10-201ENST00000335385 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LLGL2-201ENST00000167462 3480 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 TSPO-203ENST00000396265 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 AC060234.1-201ENST00000422966 474 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LYRM4-206ENST00000468929 1168 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MBP-227ENST00000526111 581 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 MRPL48-210ENST00000542303 661 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 ZNF596-213ENST00000640035 1163 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
HECW1Q76N89 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC23.65■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.7 ms