Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZP82

CCDC141, Coiled-coil domain-containing protein 141, humanhuman

Predictions only

Length 1,450 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC141Q6ZP82 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SLC43A2-202ENST00000412517 1658 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MBD3L5-201ENST00000329753 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RAB1A-201ENST00000398529 1198 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC011742.3-201ENST00000439053 820 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 GEMIN7-204ENST00000591747 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PYY-202ENST00000592796 580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC128714.1-201ENST00000637035 887 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MBD3L2B-202ENST00000637800 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TLE3-212ENST00000558201 2766 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 METTL25-201ENST00000248306 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CD8A-204ENST00000409781 597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SLC16A6P1-201ENST00000413214 1059 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC243964.2-201ENST00000590796 829 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RAP1GDS1-203ENST00000380158 2085 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SLC38A5-213ENST00000620913 1993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 OSM-202ENST00000403389 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FGFR1-238ENST00000532791 5590 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NFE2L1-214ENST00000582155 1998 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 THOC6-201ENST00000253952 1246 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KRTAP10-3-201ENST00000391620 971 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 HLA-DQB2-229ENST00000411527 1059 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KLK11-204ENST00000453757 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NAT9-224ENST00000583757 583 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC132192.2-201ENST00000596206 1147 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TRMT10C-201ENST00000309922 1819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 STYXL1-201ENST00000248600 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FKBP4P6-201ENST00000457486 1332 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SYCE2-201ENST00000293695 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 IYD-204ENST00000392255 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 LINC01118-202ENST00000409912 1023 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 CLDN11-207ENST00000486975 1139 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
CCDC141Q6ZP82 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms