Protein–RNA interactions for Protein: Q6Q0C0

TRAF7, E3 ubiquitin-protein ligase TRAF7, humanhuman

Predictions only

Length 670 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF7Q6Q0C0 ALOX12-201ENST00000251535 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FLYWCH1-203ENST00000416288 4963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CYP4F2-202ENST00000221700 2407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SLC1A5-205ENST00000594991 2031 ntTSL 2 BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.89■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 BEX5-201ENST00000333643 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CIDEC-201ENST00000336832 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CIDEC-203ENST00000423850 1036 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL157373.2-201ENST00000437559 784 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CIDEC-206ENST00000455015 1123 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 APOA2-204ENST00000464492 530 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ANAPC13-205ENST00000511751 896 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LINC00511-205ENST00000578206 908 ntTSL 3 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC106872.11-201ENST00000605838 421 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AQP3-201ENST00000297991 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MRFAP1-202ENST00000382581 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC005833.1-201ENST00000280684 4237 ntAPPRIS P1 BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HSFX2-201ENST00000598963 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.88■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL023775.1-201ENST00000454907 1746 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ETV4-211ENST00000591713 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CHRDL1-205ENST00000482160 1537 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 FNTAP2-201ENST00000430308 634 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL139420.1-201ENST00000439394 653 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AC139149.1-202ENST00000442532 783 ntTSL 3 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 REEP1-202ENST00000453231 940 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 IKZF1-217ENST00000612658 962 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 DCST1-201ENST00000295542 2279 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 NOS2P2-202ENST00000639528 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.87■□□□□ 0.29
TRAF7Q6Q0C0 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC16.87■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms