Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI14

SLC9A4, Sodium/hydrogen exchanger 4, humanhuman

Predictions only

Length 798 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC9A4Q6AI14 TP73-209ENST00000603362 1668 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GSN-215ENST00000545652 2428 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PGBD5-201ENST00000391860 10961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TAF6-209ENST00000452041 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TRIM72-201ENST00000322122 8500 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CRYM-201ENST00000219599 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MDFIC-202ENST00000393486 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LMF1-AS1-202ENST00000569574 1408 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 NMRAL1-201ENST00000283429 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 YWHAZ-204ENST00000395953 994 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC093702.1-201ENST00000423433 367 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC114501.2-201ENST00000439631 535 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GOLGA5-201ENST00000163416 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CPSF1-213ENST00000620219 4462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TPBG-202ENST00000535040 3392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CPT2-201ENST00000371486 3094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC29A2-207ENST00000619145 2380 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CLCN2-201ENST00000265593 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MB-201ENST00000359787 1170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MB-202ENST00000397326 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 MB-203ENST00000397328 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ARHGEF4-205ENST00000409359 5489 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SLC9A4Q6AI14 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms