Protein–RNA interactions for Protein: Q5JRX3

PITRM1, Presequence protease, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 1,037 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PITRM1Q5JRX3 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 IL6ST-209ENST00000502326 3007 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PROSER1-211ENST00000625998 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 FOXI2-201ENST00000388920 3217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MON2-213ENST00000552738 5543 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RAD23B-201ENST00000358015 4119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 GIMAP3P-201ENST00000495150 836 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 AC011466.1-201ENST00000595201 566 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 RPL23AP53-203ENST00000606975 736 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 PCDHGC3-204ENST00000617222 731 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
PITRM1Q5JRX3 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TPD52L2-205ENST00000352482 2339 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TPD52L2-210ENST00000615907 2310 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PDE8B-201ENST00000264917 5956 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 MYEF2-201ENST00000267836 2958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 INTS11-203ENST00000419704 1798 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SERF1A-205ENST00000507348 663 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC016727.1-204ENST00000578974 420 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC111170.2-201ENST00000585369 768 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC005253.2-201ENST00000593791 432 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PITRM1Q5JRX3 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 97.6 ms