Protein–RNA interactions for Protein: Q4G0W2

DUSP28, Dual specificity phosphatase 28, humanhuman

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DUSP28Q4G0W2 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 C8orf74-201ENST00000304519 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CATSPERZ-201ENST00000328404 743 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 IQCF3-203ENST00000444293 450 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SCARNA20.5-201ENST00000516991 142 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FBXL8-208ENST00000521920 574 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HPSE2-205ENST00000614306 447 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 STX3-201ENST00000337979 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ABCB7-201ENST00000253577 2377 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRTFDC1-203ENST00000376378 747 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RPL13A-201ENST00000391857 1181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TISP43-201ENST00000409793 538 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ZNF527-203ENST00000483919 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CCDC71L-202ENST00000523505 4232 ntAPPRIS P2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SMO-201ENST00000249373 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 TMEM52-203ENST00000378602 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 HNRNPA1P32-201ENST00000396326 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 LIMS4-201ENST00000413601 1215 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
DUSP28Q4G0W2 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms