Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

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Length 1,714 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC104073.2-201ENST00000453737 312 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TNNT2-214ENST00000458432 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC104333.4-201ENST00000632866 554 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MBTD1-201ENST00000376381 1420 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AP000593.2-201ENST00000542775 1433 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC026471.1-201ENST00000564629 3026 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL096870.2-201ENST00000565988 2108 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PLXDC2-202ENST00000377242 2822 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RETREG1-201ENST00000306320 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ILF3-AS1-201ENST00000591501 1983 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 BUD31-202ENST00000403633 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL357558.1-201ENST00000416646 456 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 LINC00466-203ENST00000436475 1059 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL096772.1-201ENST00000451135 781 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 HNRNPA1P36-201ENST00000521313 955 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC009119.2-201ENST00000561562 723 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MIR4683-201ENST00000579659 81 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RN7SL163P-201ENST00000583100 276 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BE-201ENST00000614097 497 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC005618.3-201ENST00000624928 458 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZNF805-201ENST00000354309 2396 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MGAT2-201ENST00000305386 2687 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 KCNA2-201ENST00000316361 2827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL357563.1-201ENST00000404728 395 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL136988.1-201ENST00000414640 1029 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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COL24A1Q17RW2 UBXN7-AS1-201ENST00000442941 386 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
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COL24A1Q17RW2 LINC02440-201ENST00000545276 680 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC100778.2-201ENST00000580150 483 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 SNUPN-206ENST00000564675 1682 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RPN1-207ENST00000497289 2137 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 TCEA1-201ENST00000396401 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CMTM5-202ENST00000342473 725 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 UQCRQ-203ENST00000378670 839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CMTM5-205ENST00000397227 818 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC012362.1-201ENST00000434906 739 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AL139010.1-202ENST00000452528 1041 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 CMTM5-208ENST00000555731 831 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PAM16-211ENST00000575848 518 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PAM16-214ENST00000576217 493 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 RN7SL596P-201ENST00000582123 288 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
COL24A1Q17RW2 GLUD1P2-203ENST00000631118 486 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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