Protein–RNA interactions for Protein: Q17R55

FAM187B, Protein FAM187B, humanhuman

Predictions only

Length 369 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM187BQ17R55 LINC01939-201ENST00000445279 694 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ATXN2-AS-201ENST00000547021 485 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SNX29P1-201ENST00000548357 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AP005482.1-201ENST00000563722 1273 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AL008721.1-201ENST00000609964 604 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LINC02351-201ENST00000614728 289 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 WNT11-204ENST00000621122 789 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PBX3-207ENST00000447726 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MUTYH-234ENST00000528013 1662 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NKIRAS1-201ENST00000388759 2335 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SORT1-201ENST00000256637 7028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ARFGAP1-201ENST00000353546 2776 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TMA16-201ENST00000358572 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ANKRD19P-201ENST00000338192 862 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RAB34-210ENST00000436730 863 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 FTH1P14-201ENST00000482930 551 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC021054.1-202ENST00000543884 599 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SNAP25-AS1-208ENST00000605592 556 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC092506.1-204ENST00000634888 1066 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ZAP70-201ENST00000264972 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 STIP1-201ENST00000305218 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NEU3-206ENST00000532963 1643 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC008894.3-201ENST00000624324 3103 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 SHBG-202ENST00000380450 1271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GZMB-202ENST00000382540 816 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RALY-AS1-203ENST00000440595 660 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ELFN1-AS1-202ENST00000453348 637 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC007551.1-201ENST00000457394 519 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 RMDN1-212ENST00000519966 1164 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MRNIP-220ENST00000523084 1096 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 GZMH-203ENST00000557220 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC027601.2-201ENST00000571085 805 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
FAM187BQ17R55 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 71.3 ms