Protein–RNA interactions for Protein: Q16658

FSCN1, Fascin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 493 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FSCN1Q16658 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC133785.1-201ENST00000429282 2824 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 MEST-202ENST00000341441 2443 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CSH2-201ENST00000336844 1173 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CSH2-202ENST00000345366 598 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SNX21-203ENST00000372541 771 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TMEM107-203ENST00000431792 455 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HSPB1P2-201ENST00000448722 546 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC005077.2-201ENST00000449786 690 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LINC02273-201ENST00000499452 1592 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ZSCAN32-210ENST00000573830 668 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KRTAP10-7-201ENST00000609664 1578 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL445288.1-201ENST00000610846 654 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PCMTD2-207ENST00000609372 1321 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KCNQ1-201ENST00000155840 3245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SPAG6-202ENST00000376603 2770 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TMEM141-201ENST00000290079 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ZSCAN32-204ENST00000422427 1267 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC244250.1-201ENST00000438185 451 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 MAP1LC3B2-202ENST00000556529 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC021594.1-201ENST00000587174 636 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CD276-213ENST00000561213 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC007381.1-201ENST00000457668 2005 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TUBA1C-201ENST00000301072 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LINGO1-204ENST00000561030 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 VSIG2-201ENST00000326621 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC079178.1-201ENST00000420915 656 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SAP30L-202ENST00000426761 777 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 HIST2H2BC-201ENST00000498492 580 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AC007406.3-201ENST00000537295 1063 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SSTR5-AS1-201ENST00000565992 575 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LRRC37A6P-204ENST00000575554 573 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SLC35G4-201ENST00000588001 1017 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
FSCN1Q16658 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
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