Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 PCSK4-201ENST00000300954 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 PIP4K2C-207ENST00000550465 1532 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC024909.3-201ENST00000611513 2257 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 POLR2F-208ENST00000470701 584 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 KSR1-207ENST00000578981 748 ntTSL 4 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AL391650.2-201ENST00000640097 941 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MAGEA2-208ENST00000623438 2009 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SBSPON-201ENST00000297354 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FAM153B-220ENST00000515817 1966 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AKIP1-202ENST00000309357 1232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ZBTB12BP-201ENST00000314232 1122 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 GAPDHP40-201ENST00000505218 1006 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 RHOXF1P1-202ENST00000635473 501 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
PSMD5Q16401 FBXL16-202ENST00000397621 3547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD5Q16401 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
PSMD5Q16401 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
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