Protein–RNA interactions for Protein: Q15811

ITSN1, Intersectin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,721 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITSN1Q15811 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SPERT-204ENST00000610924 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC005906.2-217ENST00000639573 1711 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TSPAN17-209ENST00000515708 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MYL6-219ENST00000551589 1438 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL645608.5-201ENST00000398216 443 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 C14orf178-202ENST00000439131 632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MSRA-203ENST00000441698 788 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC125604.1-201ENST00000496255 707 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NKX3-1-202ENST00000523261 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC134698.3-201ENST00000523880 214 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC015660.1-201ENST00000560103 395 ntTSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RN7SL774P-201ENST00000577467 290 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RUNX1-203ENST00000358356 2720 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL008718.2-201ENST00000609206 1313 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PCYOX1L-201ENST00000274569 2546 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC011840.2-201ENST00000563063 1520 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KAAG1-201ENST00000274766 1382 ntAPPRIS P1 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 ADCYAP1-203ENST00000579794 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KRT76-201ENST00000332411 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PRSS30P-202ENST00000475030 752 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LY6G6C-202ENST00000495859 937 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MIR4706-201ENST00000582134 82 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 FSD1L-206ENST00000481272 1804 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 LINC02405-201ENST00000512624 1361 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AEBP1-206ENST00000450684 2571 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 WASH3P-204ENST00000558784 1644 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC091046.1-201ENST00000331871 207 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 GTF2A2-205ENST00000396064 633 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 RPL14-202ENST00000396203 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 GTF2A2-208ENST00000484743 408 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AL136088.1-202ENST00000525871 439 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 AC023824.4-202ENST00000569557 849 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 FAAP24-204ENST00000590179 784 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SYBU-219ENST00000528647 2995 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 ANXA6-202ENST00000377751 1430 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SERF2-209ENST00000409646 559 ntTSL 4 BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PRSS30P-204ENST00000489864 650 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SUPT4H1P2-201ENST00000501248 353 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 CU633904.3-201ENST00000624042 1029 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 UBL7-AS1-203ENST00000564621 1612 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
ITSN1Q15811 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITSN1Q15811 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
ITSN1Q15811 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITSN1Q15811 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITSN1Q15811 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
ITSN1Q15811 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms