Protein–RNA interactions for Protein: Q15113

PCOLCE, Procollagen C-endopeptidase enhancer 1, humanhuman

Predictions only

Length 449 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCOLCEQ15113 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FOXRED1-201ENST00000263578 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RNF167-214ENST00000576229 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 IGHV3-35-201ENST00000390617 366 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C2orf27AP3-201ENST00000434123 579 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 H2AFV-207ENST00000446531 1041 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL157834.2-201ENST00000451737 663 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 HOXC-AS3-201ENST00000509870 544 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C8orf37-AS1-202ENST00000517655 562 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC01887-202ENST00000584734 860 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AL354718.3-201ENST00000616414 581 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CR382287.1-201ENST00000623954 586 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 DNAJC2-203ENST00000379263 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 COBL-201ENST00000265136 5291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 GOSR2-211ENST00000623037 1814 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 POLR2I-201ENST00000221859 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RAB41-201ENST00000276066 1071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AGRP-201ENST00000290953 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RAB41-202ENST00000374473 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 MACROD2-AS1-201ENST00000439451 1230 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
PCOLCEQ15113 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
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