Protein–RNA interactions for Protein: Q15004

PCLAF, PCNA-associated factor, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCLAFQ15004 KLHL26-201ENST00000300976 4407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SRPRA-206ENST00000532259 2453 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAB37-206ENST00000392615 2655 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZNF259P1-201ENST00000407656 1365 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KLK5-203ENST00000593428 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PCDHA7-201ENST00000356878 2922 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TPRX1-201ENST00000322175 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NDRG2-226ENST00000554104 2146 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DDT-201ENST00000350608 671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HIST3H2BA-201ENST00000436555 524 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC093904.3-201ENST00000492300 368 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BANF1P1-201ENST00000553684 263 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AP3S2-204ENST00000558011 738 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 OPCML-IT1-201ENST00000533859 2936 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SLC32A1-201ENST00000217420 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 EHF-210ENST00000531794 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 KRT15-201ENST00000254043 5237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 FARS2-202ENST00000324331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 BAX-203ENST00000354470 433 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
PCLAFQ15004 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.1 ms