Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CNN1-210ENST00000592923 1848 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KCNG4-202ENST00000568181 2199 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 STC1-202ENST00000524323 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TEKT4P2-201ENST00000416067 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ATXN7L1-207ENST00000477775 2426 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TPGS2-201ENST00000334295 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SCARA5-201ENST00000354914 4026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PDE7A-203ENST00000401827 3673 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FOXH1-201ENST00000377317 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZFP64-201ENST00000216923 3264 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MOCS1-201ENST00000340692 2747 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TCP10-210ENST00000617120 2182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PBX3-201ENST00000342287 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PLXNC1-202ENST00000545312 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 C5orf24-204ENST00000504727 2923 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 DPYSL4-201ENST00000338492 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ADGRB2-205ENST00000398547 4857 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IL6R-201ENST00000344086 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC041040.2-201ENST00000622926 2899 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 AC126335.2-201ENST00000623362 4637 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 GPS1-208ENST00000578552 1874 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 DFNA5-202ENST00000409775 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 IFRD1-205ENST00000429071 1938 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 NTRK2-201ENST00000277120 8633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
CUL3Q13618 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
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