Protein–RNA interactions for Protein: Q13535

ATR, Serine/threonine-protein kinase ATR, humanhuman

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Length 2,644 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRQ13535 NREP-204ENST00000419114 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 RAD51C-203ENST00000421782 567 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LINC00313-205ENST00000427188 967 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 HCFC1-AS1-201ENST00000438219 350 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NDUFC1-210ENST00000539387 725 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL132780.4-201ENST00000624870 1135 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ANP32A-203ENST00000465139 2440 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CYP2A7-201ENST00000291764 2128 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ALAS2-203ENST00000396198 1936 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC053503.3-201ENST00000448375 114 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZAP70-202ENST00000451498 1085 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC012213.1-201ENST00000517376 722 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LINC01517-203ENST00000616194 908 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ALKBH2-208ENST00000619381 895 ntTSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 SAR1B-208ENST00000507419 2287 ntTSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 UBL7-201ENST00000361351 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TUBGCP2-203ENST00000368563 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC134407.2-201ENST00000625089 1978 ntBASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CCDC121-202ENST00000394775 1472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PLEKHG4-201ENST00000360461 6782 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CHCHD7-202ENST00000355315 1535 ntTSL 2 BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 ARHGEF5-202ENST00000471847 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.09□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GCSHP3-201ENST00000431120 391 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 NOP16-211ENST00000621444 954 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 AC025262.2-201ENST00000623975 1056 ntBASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.47
ATRQ13535 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 IDH3B-212ENST00000613370 1400 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 Z84468.1-201ENST00000626321 1408 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHIA-201ENST00000343320 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CHIA-204ENST00000369740 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MANEAL-201ENST00000329006 1930 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC026320.2-201ENST00000434379 478 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 MIR6816-201ENST00000620368 66 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 SLC27A5-207ENST00000601355 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 IGFBP3-203ENST00000381086 2322 ntTSL 2 BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 RGS14-201ENST00000408923 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 EZH2-201ENST00000320356 2639 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
ATRQ13535 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.08□□□□□ -0.48
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