Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CYP4F3-202ENST00000585846 2056 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RGS6-218ENST00000556437 1689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PHTF1-205ENST00000393357 3244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TBC1D10A-203ENST00000403362 1833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 EIF4EBP3-201ENST00000310331 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TNFRSF14-AS1-206ENST00000452793 569 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MTUS1-215ENST00000519066 567 ntTSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AC129926.1-201ENST00000581944 614 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 HMBS-216ENST00000543090 1347 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 RDH10-201ENST00000240285 3949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
PDE3BQ13370 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PCBP4-201ENST00000322099 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CCDC12-201ENST00000292314 1017 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL845321.1-202ENST00000432011 786 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC116456.1-201ENST00000526646 815 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AKIP1-210ENST00000534147 1022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AP000721.1-201ENST00000535431 559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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PDE3BQ13370 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 COX6B1-204ENST00000592141 660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC02028-216ENST00000609015 732 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 RPP40-207ENST00000618533 1056 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MAPK14-204ENST00000468133 1376 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ARHGEF1-204ENST00000378152 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC018467.1-201ENST00000421581 717 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 METTL21A-209ENST00000448823 869 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL118558.1-202ENST00000557242 451 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 AL158212.4-201ENST00000624062 1286 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PDE3BQ13370 CACNA1B-205ENST00000371363 9758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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