Protein–RNA interactions for Protein: Q13367

AP3B2, AP-3 complex subunit beta-2, humanhuman

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Length 1,082 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3B2Q13367 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ADAMTSL1-208ENST00000380570 931 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 VAMP1-202ENST00000396308 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL513217.1-202ENST00000458139 600 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC093525.8-201ENST00000624099 1342 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC17.61■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NTRK2-206ENST00000376213 5560 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PTPA-203ENST00000348141 2737 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PTPA-207ENST00000393370 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC068898.1-201ENST00000440750 335 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC073389.2-202ENST00000607450 441 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 DPEP1-202ENST00000393092 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
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AP3B2Q13367 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 EPB41L3-207ENST00000545076 3190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GFOD1-206ENST00000612338 2481 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 CRY2-201ENST00000417225 2053 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ANXA6-211ENST00000521512 1793 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SLC25A3-217ENST00000552981 1351 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 TRAF3IP1-202ENST00000391993 4003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 HYAL1-208ENST00000457214 1084 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AC084864.1-201ENST00000496217 305 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
AP3B2Q13367 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC17.59■□□□□ 0.41
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