Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 USP32P1-208ENST00000506594 1164 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 FLT3LG-205ENST00000596435 1034 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 AL512343.1-201ENST00000605837 169 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LINC01002-214ENST00000632102 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 PHYHD1-202ENST00000353176 1374 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CNTN1Q12860 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RBPMS2-202ENST00000560606 1746 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SPG11-215ENST00000559193 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RAB35-201ENST00000229340 2945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CHST10-201ENST00000264249 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SYNGR1-205ENST00000406293 564 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC017116.1-201ENST00000445938 708 ntTSL 3 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 ENPP7P5-201ENST00000541031 1031 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 FAM171B-202ENST00000612606 940 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CBARP-204ENST00000590083 4261 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
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CNTN1Q12860 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 WDR20-211ENST00000556807 2382 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 HACD3-202ENST00000442729 1332 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AP000317.2-201ENST00000362077 641 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 UCHL3-201ENST00000377595 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 STK17A-201ENST00000319357 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
CNTN1Q12860 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
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