Protein–RNA interactions for Protein: Q0P6D6

CCDC15, Coiled-coil domain-containing protein 15, humanhuman

Predictions only

Length 951 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC15Q0P6D6 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DEGS2-201ENST00000305631 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 THRA-203ENST00000450525 4895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SH2D3C-206ENST00000429553 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ITGBL1-207ENST00000622834 2369 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM189-203ENST00000371656 1973 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DCAKD-201ENST00000310604 2122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ATP6V0A1-204ENST00000537728 2774 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF710-AS1-201ENST00000558334 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 E2F3-201ENST00000346618 4749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RALGAPA1-203ENST00000389698 7864 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MMADHC-203ENST00000428879 1726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM50A-201ENST00000374358 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GGT1-201ENST00000248923 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FDPS-201ENST00000356657 1478 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RBX1-201ENST00000216225 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MRPS6-201ENST00000399312 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AL080243.2-201ENST00000418783 582 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 BLMH-201ENST00000261714 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 AC138904.3-201ENST00000635780 2681 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 R3HDM2P2-201ENST00000401880 2116 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 ASIC4-202ENST00000358078 2741 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 EIF2B3-210ENST00000620860 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
CCDC15Q0P6D6 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms