Protein–RNA interactions for Protein: Q08170

SRSF4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 494 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SRSF4Q08170 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TBCE-201ENST00000366601 1966 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TMCO3-207ENST00000474393 2843 ntTSL 2 BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 EGLN1-201ENST00000366641 7097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.31□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ALAS2-201ENST00000330807 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL353732.1-201ENST00000569618 1459 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BAIAP2-220ENST00000575712 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZXDA-201ENST00000358697 4113 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ILDR1-202ENST00000344209 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CLPP-201ENST00000245816 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BASP1P1-201ENST00000430708 665 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC069335.1-201ENST00000489972 472 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ILF2-205ENST00000615950 1906 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CNNM2-203ENST00000433628 3857 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ARNT2-204ENST00000527771 2458 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 BCKDHA-201ENST00000269980 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TGFBR2-202ENST00000359013 4605 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 MEOX2-201ENST00000262041 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 IQCE-201ENST00000325979 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.3□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SHTN1-201ENST00000260777 5308 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TPO-201ENST00000329066 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 TREML5P-201ENST00000421694 576 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 ZNF706-201ENST00000311212 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 POLI-208ENST00000579534 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
SRSF4Q08170 CCDC116-201ENST00000292779 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms