Protein–RNA interactions for Protein: Q05952

TNP2, Nuclear transition protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 138 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNP2Q05952 AL355314.1-201ENST00000453639 316 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TVP23BP2-201ENST00000455082 615 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 NFU1-207ENST00000462320 558 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM162A-202ENST00000469967 1015 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC01184-209ENST00000514573 609 ntTSL 3 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MTND4LP31-201ENST00000514859 294 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CARD8-214ENST00000520007 614 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC068768.1-204ENST00000544890 796 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 XRCC3-210ENST00000554974 575 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DPF3-210ENST00000556509 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL109741.3-201ENST00000561748 592 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC105020.3-201ENST00000566036 560 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC009133.2-201ENST00000566537 547 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MTND4LP25-201ENST00000570218 163 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
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TNP2Q05952 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AP005433.1-201ENST00000582939 620 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 E2F3P1-201ENST00000589887 1230 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC003001.2-201ENST00000616294 831 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 RBBP4P3-201ENST00000619705 1283 ntBASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 DMAC2-201ENST00000221943 1692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TXNRD2-214ENST00000491939 2238 ntTSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SGPP2-201ENST00000321276 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.62□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BRD7P6-201ENST00000431406 1860 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TNP2Q05952 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TNP2Q05952 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TNP2Q05952 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C19orf24-202ENST00000469144 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
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TNP2Q05952 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC008750.2-202ENST00000532688 729 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 TROAP-207ENST00000548311 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC034102.5-201ENST00000548731 540 ntTSL 4 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AC087392.4-201ENST00000574560 486 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 MIR4538-201ENST00000581377 78 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL117336.3-201ENST00000603160 1107 ntTSL 3 BASIC10.61□□□□□ -0.71
TNP2Q05952 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC10.61□□□□□ -0.71
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