Protein–RNA interactions for Protein: Q02224

CENPE, Centromere-associated protein E, humanhuman

Predictions only

Length 2,701 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CENPEQ02224 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HIST1H1D-201ENST00000244534 666 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC004540.1-204ENST00000449537 727 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC007319.1-201ENST00000453517 802 ntTSL 3 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 HNRNPA1P42-201ENST00000458678 957 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CYB561D1-207ENST00000527072 892 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 UBA52-208ENST00000596304 554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LILRA2-208ENST00000629481 661 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RCHY1-202ENST00000380840 1735 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CELF2-206ENST00000608830 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 VWCE-205ENST00000535710 1437 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SEPT11-206ENST00000505788 2079 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PROK2-201ENST00000295619 1022 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PRRC2B-207ENST00000458550 899 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RN7SL396P-201ENST00000471086 295 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PHBP15-201ENST00000574228 665 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 INCA1-203ENST00000575780 1221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ZNF584-209ENST00000599238 2288 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MTA1-207ENST00000435036 2888 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PRAL-201ENST00000624952 3286 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CBS-202ENST00000359624 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CBSL-203ENST00000618024 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LINC00680-205ENST00000450081 1593 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC244197.1-201ENST00000456494 951 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TIMM17B-204ENST00000465150 964 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FRMD4A-208ENST00000493380 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC113383.1-201ENST00000514696 582 ntTSL 4 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C8orf31-207ENST00000524181 1199 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC025154.2-201ENST00000550530 445 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC093752.3-201ENST00000567343 901 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 WDR6-222ENST00000615452 1949 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LRRC59-203ENST00000576448 1531 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 IL23A-201ENST00000228534 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TP53I3-203ENST00000407482 747 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC012442.2-201ENST00000414784 425 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PTGES3-203ENST00000436399 941 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AP003398.1-201ENST00000531124 318 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 TMEM231-206ENST00000565067 1078 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 EHBP1-209ENST00000431489 5076 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CTSD-211ENST00000637387 1597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CMTM5-201ENST00000339180 1173 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 CRHR1-205ENST00000352855 1146 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 C14orf178-201ENST00000355883 642 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 DARS-AS1-204ENST00000444406 442 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 LYPLA2P1-203ENST00000447689 696 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 SDHAF2-206ENST00000542074 835 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
CENPEQ02224 PLEKHA8P1-203ENST00000545609 277 ntTSL 3 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 69.5 ms