Protein–RNA interactions for Protein: Q00610

CLTC, Clathrin heavy chain 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,675 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLTCQ00610 AL157414.3-201ENST00000624276 1954 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC116609.2-201ENST00000431542 256 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RPL7P35-201ENST00000446943 740 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 VDAC3-211ENST00000522572 799 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ERICH5-202ENST00000545282 596 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ITGA9-AS1-213ENST00000614028 913 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM90A2P-201ENST00000511144 1395 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM90A25P-201ENST00000528404 1395 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TMEM130-202ENST00000345589 2261 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM156B-207ENST00000616419 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM156A-212ENST00000617970 2032 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RASSF3-202ENST00000336061 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ETV2-201ENST00000379023 926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SETD7-203ENST00000406354 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC010234.1-201ENST00000494599 870 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM104A-204ENST00000580032 451 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AP005901.3-201ENST00000581666 415 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TGFB1I1-201ENST00000361773 1773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 REM1-201ENST00000201979 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 KRT18P36-201ENST00000411618 1276 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NSUN5P1-203ENST00000422386 972 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AL591242.1-203ENST00000434329 374 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TP53AIP1-201ENST00000458238 777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DFNA5-207ENST00000419307 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MYADM-202ENST00000391768 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 REXO1L5P-201ENST00000622260 2098 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 C18orf8-201ENST00000269221 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 C1orf228-219ENST00000535358 1685 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 GAREM2-201ENST00000401533 4161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 THAP4-202ENST00000402136 785 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LINC00028-201ENST00000435497 587 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CMC2-224ENST00000630396 481 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LETMD1-206ENST00000547008 1665 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 UROD-201ENST00000246337 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 FAM151A-202ENST00000371304 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 EML3-201ENST00000278845 3017 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AKR1A1-202ENST00000372070 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SYCN-201ENST00000318438 573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AC012360.1-201ENST00000433219 674 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 AP000358.1-201ENST00000456260 156 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 LTBR-209ENST00000541102 1084 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 REC114-202ENST00000560581 833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MIR4522-201ENST00000584932 87 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 MIR6858-201ENST00000620733 67 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CLTCQ00610 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.7 ms