Protein–RNA interactions for Protein: P98173

FAM3A, Protein FAM3A, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3AP98173 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 STK33-217ENST00000534493 1895 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CDCP2-201ENST00000371330 2723 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SIX5-204ENST00000622857 1401 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 NCBP2-203ENST00000422610 676 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 Z92544.3-201ENST00000624747 417 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RAPSN-203ENST00000524487 1462 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 SPEG-201ENST00000312358 10782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 RASA1-201ENST00000274376 3752 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CENPT-202ENST00000440851 2200 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PHF10-205ENST00000612128 4395 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 GPM6A-210ENST00000506894 2614 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LONP1-213ENST00000590729 2626 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 CERK-201ENST00000216264 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 WSCD1-208ENST00000573634 1573 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 COCH-202ENST00000396618 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
FAM3AP98173 LFNG-202ENST00000338732 1968 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 GDF11-201ENST00000257868 8657 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TBCD-202ENST00000539345 3975 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 IGFBP2-204ENST00000456764 846 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 MIEF2-203ENST00000395704 2879 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
FAM3AP98173 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms