Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CEP63-212ENST00000513612 2903 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GNB4-201ENST00000232564 6434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DPEP1-201ENST00000261615 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AQP1-201ENST00000311813 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KNSTRN-202ENST00000416151 1899 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL122058.1-202ENST00000426580 252 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPS2P2-201ENST00000430745 888 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PSMB5-204ENST00000460922 729 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KRT8P12-202ENST00000472924 1397 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PTK7-212ENST00000476760 902 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 BCAR1-207ENST00000538440 3192 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ATF7-205ENST00000548446 1892 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ANKRD20A5P-207ENST00000581935 2089 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PIGT-246ENST00000639499 2021 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC079781.4-201ENST00000641908 219 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 LEF1-202ENST00000379951 3477 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FMNL1-206ENST00000587489 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CNN3-207ENST00000545882 1902 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MAGEA12-201ENST00000357916 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 INPP5K-201ENST00000320345 2880 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 WASH3P-207ENST00000560956 1394 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FO538757.1-201ENST00000623083 1397 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SPAG7-201ENST00000206020 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 RN7SL828P-201ENST00000607615 303 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC006538.3-201ENST00000612495 578 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PRRT2-207ENST00000572820 2403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 AC027601.1-201ENST00000575922 4506 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 SOWAHA-201ENST00000378693 3211 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
HERVK_113P63132 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms