Protein–RNA interactions for Protein: P62273

RPS29, 40S ribosomal protein S29, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 56 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS29P62273 PPP1R26-206ENST00000605660 4502 ntAPPRIS P1 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 TMEM25-206ENST00000442938 2228 ntTSL 2 BASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
RPS29P62273 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RPS29P62273 ACTL6A-202ENST00000429709 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -1
RPS29P62273 ANKEF1-201ENST00000378380 5303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.84□□□□□ -1
RPS29P62273 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 FAM135A-205ENST00000418814 6415 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 C7orf43-207ENST00000457641 2005 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC126177.1-201ENST00000547829 2218 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RPS15-201ENST00000233609 534 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RHOG-203ENST00000396979 1289 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 CRYAA-202ENST00000398132 826 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC106886.2-201ENST00000483578 883 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RHOG-204ENST00000533217 886 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 FP236240.1-204ENST00000624932 712 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 TOB2-201ENST00000327492 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ABLIM3-206ENST00000506113 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 SLC25A4-201ENST00000281456 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ACTL6A-203ENST00000450518 1750 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 MUTYH-206ENST00000372115 1888 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.83□□□□□ -1
RPS29P62273 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 TAF11-201ENST00000361288 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 ACSM2B-207ENST00000565232 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 ZNF382-202ENST00000423582 2657 ntTSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 TVP23C-203ENST00000428082 1911 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.82□□□□□ -1
RPS29P62273 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC8.82□□□□□ -1
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