Protein–RNA interactions for Protein: P61565

ERVK-21, Endogenous retrovirus group K member 21 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 698 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVK-21P61565 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LYPLAL1-AS1-201ENST00000441331 724 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CHMP1AP1-201ENST00000445563 662 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 HIST2H2BB-201ENST00000449108 381 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC100850.1-201ENST00000506768 649 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC008443.1-201ENST00000511331 1000 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 C15orf40-211ENST00000565712 559 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC110285.3-201ENST00000574472 665 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 MIR4313-201ENST00000580760 101 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TMEM205-216ENST00000593256 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 AC006480.2-201ENST00000609770 1337 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 SMIM25-203ENST00000425497 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
ERVK-21P61565 KRT8P29-201ENST00000420409 1371 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MAX-201ENST00000246163 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LAMTOR4-201ENST00000341942 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KAZN-204ENST00000400797 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MCFD2-204ENST00000409207 1113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC099552.2-201ENST00000418523 456 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL591684.1-201ENST00000434533 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL596276.2-201ENST00000447525 331 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL136982.2-201ENST00000451760 234 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 RPL23A-206ENST00000496182 636 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NME2-204ENST00000503064 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KCNK16-205ENST00000507712 889 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 EHF-205ENST00000527935 557 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PSORS1C1-206ENST00000547221 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC025154.1-201ENST00000552806 560 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP000894.2-204ENST00000577358 473 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 FBXL12-204ENST00000586469 544 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 KRT8P4-201ENST00000509735 1454 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LSR-212ENST00000602122 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 UNC5C-203ENST00000506749 2220 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 LINC02370-201ENST00000428272 2009 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AMT-224ENST00000635808 1610 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CD1E-202ENST00000368155 696 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CD1E-204ENST00000368157 399 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC131097.2-203ENST00000401641 507 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 DUSP13-206ENST00000472493 920 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AC005586.1-201ENST00000488310 577 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 MCPH1-AS1-203ENST00000525186 869 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
ERVK-21P61565 AP003171.2-201ENST00000528208 925 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.7 ms