Protein–RNA interactions for Protein: P57773

GJA9, Gap junction alpha-9 protein, humanhuman

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA9P57773 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC079328.1-201ENST00000560358 952 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TXNDC17-202ENST00000570330 459 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PPP1R18-206ENST00000615892 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DAPK1-207ENST00000469640 5899 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAN1-207ENST00000565466 2304 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LINC00658-202ENST00000420529 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TAF15-205ENST00000603777 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL162311.3-201ENST00000555918 2867 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AADAT-201ENST00000337664 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TPM2-202ENST00000360958 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL450469.1-201ENST00000418953 461 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RPL35A-205ENST00000448864 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PAX5-211ENST00000522003 1019 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 RNF41-210ENST00000552244 716 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC007333.1-201ENST00000568286 630 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TBC1D16-203ENST00000570373 961 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 EDDM13-208ENST00000637802 854 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PRSS54-201ENST00000219301 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ICAM2-201ENST00000412356 1334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL035460.1-201ENST00000380593 1866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
GJA9P57773 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 FAM181A-201ENST00000267594 1816 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SHMT2-202ENST00000414700 2006 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CDRT15-201ENST00000420162 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HNRNPA1P63-201ENST00000427917 963 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CDRT15-202ENST00000431716 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 USE1-202ENST00000445667 795 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC129492.3-201ENST00000498285 460 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 Z84485.1-202ENST00000499560 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC016629.1-201ENST00000596579 586 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 AC138627.1-207ENST00000641560 1006 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 TBC1D28-201ENST00000345096 2789 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SGCB-201ENST00000381431 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
GJA9P57773 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58 ms