Protein–RNA interactions for Protein: P51532

SMARCA4, Transcription activator BRG1, humanhuman

Predictions only

Length 1,647 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCA4P51532 OSMR-AS1-202ENST00000512519 837 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 UBE3B-206ENST00000536398 1120 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC026803.1-201ENST00000569130 274 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 NFIC-204ENST00000586919 1221 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AP005264.3-201ENST00000592370 485 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ARHGAP11B-210ENST00000622744 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FOXL2-201ENST00000330315 2917 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CRYBB1-201ENST00000215939 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 NUP210P1-201ENST00000357061 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CSHL1-205ENST00000438387 566 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RAMP3-202ENST00000481345 559 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 KLF3-AS1-204ENST00000505240 567 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 MIR4649-201ENST00000582839 64 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PLIN5-202ENST00000586133 907 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 GMFG-209ENST00000600322 622 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 KLF3-AS1-207ENST00000620339 558 ntTSL 4 BASIC27.16■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 NAA35-201ENST00000361671 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CYP4B1-202ENST00000371919 1494 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC239868.1-201ENST00000369385 493 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AL645933.1-201ENST00000440087 609 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC006122.1-201ENST00000493323 440 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CRTC3-AS1-202ENST00000559531 657 ntTSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FAM227B-210ENST00000560246 911 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 HIST2H2BB-202ENST00000609585 563 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SLC35C2-202ENST00000317734 2175 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SLC12A2-208ENST00000628403 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC245100.1-201ENST00000452996 1331 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 GOLGA8S-201ENST00000562295 1878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SLC13A5-208ENST00000573648 1723 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 TPM1-202ENST00000288398 1295 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 IMPA1-203ENST00000449740 1180 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RPL18AP3-201ENST00000462885 528 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ANXA5-210ENST00000515017 1190 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ZNF286A-219ENST00000585194 607 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 ACP7-202ENST00000594229 1149 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 AC005632.3-201ENST00000605544 308 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 FRA10AC1-201ENST00000359204 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
SMARCA4P51532 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC010547.4-201ENST00000561754 1378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PEF1-201ENST00000373703 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 UBE3C-202ENST00000389103 1626 ntTSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TMEM219-202ENST00000414689 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 RPS9P1-201ENST00000419943 583 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TMEM219-204ENST00000566848 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 MT1H-202ENST00000569155 697 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 LDLRAD4-208ENST00000586765 844 ntTSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TOMM7-207ENST00000621567 241 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CYP4B1-215ENST00000640628 969 ntTSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AAMP-201ENST00000248450 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SPACA3-201ENST00000269053 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 S100A2-203ENST00000368709 457 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 UBE4B-203ENST00000377153 1273 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 CIDEC-202ENST00000383817 1199 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AL157407.1-201ENST00000435784 904 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC012441.2-201ENST00000444843 739 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC138230.1-201ENST00000525893 664 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 AC138123.2-203ENST00000552451 653 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
SMARCA4P51532 SPACA3-205ENST00000580599 949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.9 ms