Protein–RNA interactions for Protein: P49662

CASP4, Caspase-4, humanhuman

Predictions only

Length 377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP4P49662 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TRNT1-201ENST00000251607 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SPDYC-201ENST00000377185 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MIR661-201ENST00000384842 89 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 IL32-211ENST00000525643 1272 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 IL32-213ENST00000528163 950 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 IL32-231ENST00000551513 791 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ARL16-202ENST00000570561 768 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 UBAC2-202ENST00000376440 2525 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TRIM62-204ENST00000543586 1638 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
CASP4P49662 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
CASP4P49662 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RIMS1-213ENST00000517960 4428 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RIMS1-215ENST00000520567 4442 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TM6SF2-201ENST00000389363 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FAM184B-201ENST00000265018 6622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GYPC-201ENST00000259254 1246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 CAP1-205ENST00000372802 2964 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 UBE2H-204ENST00000473814 535 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 SPCS2P1-201ENST00000561636 679 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 HCFC1R1-203ENST00000572355 610 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
CASP4P49662 AL391069.4-201ENST00000609583 481 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42 ms