Protein–RNA interactions for Protein: P49247

RPIA, Ribose-5-phosphate isomerase, humanhuman

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPIAP49247 AL450472.2-201ENST00000603663 1156 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC073263.1-201ENST00000616370 494 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 KLK15-201ENST00000326856 1389 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TSEN2-207ENST00000454502 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
RPIAP49247 BACE2-203ENST00000347667 8764 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 KLHDC2-206ENST00000554589 1641 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC068587.6-202ENST00000641839 5619 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 NSL1-201ENST00000366976 722 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AL357497.1-201ENST00000436249 666 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 EEF1DP4-201ENST00000446006 880 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ELK1P1-201ENST00000485699 580 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PDC-202ENST00000497198 1174 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MRPL36-204ENST00000508987 686 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DCUN1D5-209ENST00000531543 1030 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MIR3908-201ENST00000579798 126 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PDCD6-212ENST00000614778 1050 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ALDOA-201ENST00000338110 2384 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 CCHCR1-202ENST00000396263 2490 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SRCIN1-215ENST00000621492 4644 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SYBU-231ENST00000533065 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ASAH1-240ENST00000636997 1774 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ACSM2A-203ENST00000417235 1835 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
RPIAP49247 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 COLGALT2-201ENST00000361927 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 MAPK13-203ENST00000373766 6196 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PRSS48-202ENST00000455694 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 C12orf10-204ENST00000548632 988 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 COMMD4-217ENST00000567195 677 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 PRPS2-203ENST00000398491 1348 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 RPS28-203ENST00000600659 1326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 ABCA1-203ENST00000423487 1540 ntTSL 2 BASIC15.56■□□□□ 0.08
RPIAP49247 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.9 ms