Protein–RNA interactions for Protein: P46527

CDKN1B, Cyclin-dependent kinase inhibitor 1B, humanhuman

Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN1BP46527 ACBD5-202ENST00000375897 4173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ZSWIM8-221ENST00000604729 6075 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYLK3-201ENST00000394809 6911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYH11-211ENST00000576790 6272 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ZFAND6-201ENST00000261749 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ARHGAP4-201ENST00000350060 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DLX1-201ENST00000341900 2130 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SIDT1-201ENST00000264852 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ZNF557-201ENST00000252840 2268 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RPL15-213ENST00000611050 2363 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PRDM4-201ENST00000228437 4210 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC087386.2-201ENST00000623212 4637 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AKNA-204ENST00000374075 5038 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CHAF1A-201ENST00000301280 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CLTA-201ENST00000242285 1152 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AC002347.1-201ENST00000569543 541 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TYROBP-205ENST00000585901 620 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HNRNPDL-206ENST00000602300 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC9A3-AS1-205ENST00000606319 477 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DDX50-206ENST00000610822 2510 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SSTR2-201ENST00000357585 7683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ABCG1-203ENST00000361802 3034 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CYB561-202ENST00000392975 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYH6-201ENST00000356287 5871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ATXN2L-204ENST00000382686 3739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MYADM-203ENST00000391769 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 DNM2-204ENST00000408974 3013 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NCKIPSD-201ENST00000294129 2989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 COL9A2-202ENST00000372748 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 WDR20-205ENST00000424963 2695 ntTSL 5 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PLEKHN1-202ENST00000379409 2455 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 POLM-202ENST00000335195 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC38A1-204ENST00000546893 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
CDKN1BP46527 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.98□□□□□ -0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.2 ms