Protein–RNA interactions for Protein: P29083

GTF2E1, General transcription factor IIE subunit 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 439 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF2E1P29083 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 HIPK4-201ENST00000291823 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 KLK4-202ENST00000431178 481 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 TNNT1-209ENST00000587758 1016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 TNNT1-212ENST00000588981 1163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CA12-203ENST00000422263 2556 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ZCCHC17-206ENST00000616393 1534 ntTSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 FOSB-209ENST00000590335 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AFAP1-201ENST00000358461 7516 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 UNG-201ENST00000242576 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.6■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 DMAP1-203ENST00000372289 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 PEX5-206ENST00000434354 2253 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 PPP1R14B-202ENST00000392210 600 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC129510.1-201ENST00000579979 555 ntTSL 3 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AC011676.5-201ENST00000624864 2660 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 MOG-215ENST00000376888 1529 ntTSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SLC25A19-202ENST00000375261 1486 ntTSL 5 BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 LRRFIP1P1-201ENST00000498774 2246 ntBASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.59■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 NT5DC3-201ENST00000392876 7207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 RAB15-203ENST00000533601 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.73
GTF2E1P29083 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LAMA4-203ENST00000368638 1061 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PDGFB-202ENST00000381551 1125 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TPO-206ENST00000382269 1155 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL133267.1-201ENST00000398220 340 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 SNHG12-210ENST00000483436 682 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 LYRM9-204ENST00000503642 432 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 MIR3615-201ENST00000581999 87 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PLA2G4C-AS1-201ENST00000596552 568 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 CXorf40A-209ENST00000441248 2411 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 VGLL2-202ENST00000352536 1709 ntTSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PCBP4-205ENST00000461554 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
GTF2E1P29083 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.58■□□□□ 0.72
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms