Protein–RNA interactions for Protein: P25789

PSMA4, Proteasome subunit alpha type-4, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMA4P25789 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SNPH-203ENST00000614659 5354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FAM114A2-215ENST00000522858 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ZEB2-225ENST00000558170 4012 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 VPS36-207ENST00000611132 4607 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 TMEM201-202ENST00000340381 3776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 GUCD1-206ENST00000435822 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SORCS2-201ENST00000329016 5582 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PRR23C-201ENST00000413199 2791 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 SPAG9-201ENST00000262013 8273 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 PIDD1-202ENST00000411829 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
PSMA4P25789 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC027117.2-201ENST00000522768 510 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AP000777.2-201ENST00000539897 501 ntTSL 4 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 TKT-202ENST00000423516 2075 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 RNF8-202ENST00000373479 5631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 WDR20-203ENST00000335263 2616 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC009090.5-201ENST00000624886 2285 ntBASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
PSMA4P25789 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 TBPL2-201ENST00000247219 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 KCNT1-208ENST00000488444 3696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 PDLIM7-201ENST00000355572 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AMACR-204ENST00000382085 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 RPSAP43-201ENST00000402237 625 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC093151.3-201ENST00000425554 623 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC006042.2-201ENST00000428660 568 ntTSL 4 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 GPX1P2-201ENST00000429271 606 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
PSMA4P25789 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 129.6 ms