Protein–RNA interactions for Protein: P23229

ITGA6, Integrin alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 1,130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA6P23229 TUBGCP2-202ENST00000368562 2685 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NDRG2-207ENST00000397847 2084 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 EIF2B3-201ENST00000360403 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ZNRD1-201ENST00000332435 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SPDYE7P-201ENST00000355920 1064 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 C17orf51-202ENST00000412778 877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC008115.1-201ENST00000542291 150 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NOP14-201ENST00000314262 2889 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 VAV2-202ENST00000371851 5101 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SELENOV-201ENST00000335426 1704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 SELENOV-205ENST00000622070 1704 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.65
ITGA6P23229 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 EMC4-201ENST00000249209 852 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC128709.2-201ENST00000438408 558 ntTSL 4 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DSCR3-207ENST00000476950 937 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC126768.2-201ENST00000511693 718 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC009908.1-201ENST00000523030 412 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FAM192A-212ENST00000566077 1066 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC010328.2-201ENST00000597698 1111 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MAX-205ENST00000358664 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HDAC8-209ENST00000373589 1740 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 KCNJ2-202ENST00000535240 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 BPGM-201ENST00000344924 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 LAP3-201ENST00000226299 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TBRG4-201ENST00000258770 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C9orf16-201ENST00000372994 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL139158.2-202ENST00000428151 573 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C1QTNF6-203ENST00000434784 975 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 FAM25G-201ENST00000452267 345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DUX4L45-201ENST00000566406 1057 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 MIR4525-201ENST00000580000 75 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 ETV2-208ENST00000621247 941 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 TPPP-201ENST00000360578 6022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 C17orf113-201ENST00000587304 3746 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
ITGA6P23229 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.5 ms