Protein–RNA interactions for Protein: P20248

CCNA2, Cyclin-A2, humanhuman

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Length 432 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNA2P20248 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MRPL34-205ENST00000600434 793 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SMN2-216ENST00000638794 846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MYO3A-201ENST00000265944 5581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 C5orf66-206ENST00000624272 2479 ntTSL 2 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GLI2-203ENST00000361492 6768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FOXRED2-201ENST00000216187 3933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ARHGAP23P1-201ENST00000562773 1937 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NKIRAS2-201ENST00000307641 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MXD1-206ENST00000540449 5580 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RUNX1T1-251ENST00000615601 7372 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 KIAA2026-201ENST00000381461 6884 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC008761.1-201ENST00000595363 217 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZNF485-201ENST00000361807 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TLN1-201ENST00000314888 8823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZNF655-212ENST00000424881 4666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ST20-AS1-201ENST00000560255 4223 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BAK1-201ENST00000360661 2132 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LIMK2-204ENST00000406516 2657 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AUTS2-217ENST00000611706 4583 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 HNRNPUL1-205ENST00000593587 2725 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC010247.2-201ENST00000559786 1955 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SEPT9-228ENST00000590294 2816 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MYADM-205ENST00000391771 3111 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 RAD51D-203ENST00000394589 2287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 AC117489.1-201ENST00000625169 3217 ntBASIC14.83□□□□□ -0.03
CCNA2P20248 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
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