Protein–RNA interactions for Protein: O43300

LRRTM2, Leucine-rich repeat transmembrane neuronal protein 2, humanhuman

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Length 516 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM2O43300 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ZNF324B-201ENST00000336614 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MAP3K10-201ENST00000253055 3436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 OSM-203ENST00000403463 464 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CENPM-206ENST00000407253 818 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AP001995.1-201ENST00000531784 1157 ntTSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GNG2-209ENST00000555472 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TRAPPC6A-204ENST00000588062 695 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AC008494.3-201ENST00000606615 944 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 AL136531.2-202ENST00000617804 573 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 CCDC144A-202ENST00000340621 2214 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 GSN-203ENST00000373808 2664 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.05
LRRTM2O43300 PDE3A-201ENST00000359062 7576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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LRRTM2O43300 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CMA1-201ENST00000206446 633 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 TMEM52-201ENST00000310991 929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 SPDYE19P-201ENST00000338590 713 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAGEC1-202ENST00000406005 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC091544.3-201ENST00000556424 531 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
LRRTM2O43300 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
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