Protein–RNA interactions for Protein: C9JL84

HHLA1, HERV-H LTR-associating protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HHLA1C9JL84 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FDFT1-202ENST00000443614 1393 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LINC00116-201ENST00000414416 2051 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 DARS-AS1-209ENST00000594219 1420 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TEKT4-201ENST00000295201 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RPS9-205ENST00000402367 1617 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC010424.3-201ENST00000635510 1745 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 IL9R-201ENST00000244174 1944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KANSL1L-201ENST00000281772 4754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 STXBP5-207ENST00000546097 2160 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KRT8P44-201ENST00000441609 1350 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NDUFA3-203ENST00000391763 338 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RAB3A-202ENST00000464076 1253 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC093904.1-201ENST00000474561 455 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ASAH1-221ENST00000636128 1608 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CTSW-201ENST00000307886 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 THEMIS2-202ENST00000373921 2687 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FBLN7-203ENST00000409450 1394 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MRPL53-201ENST00000258105 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NINJ2-201ENST00000305108 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 MGST3-203ENST00000367885 680 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AL391069.3-201ENST00000455503 618 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC012640.1-201ENST00000509915 688 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 SNHG15-207ENST00000582727 1039 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC233724.13-201ENST00000598383 410 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
HHLA1C9JL84 ELMO3-201ENST00000360833 2480 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms