Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TMEM210-201ENST00000413619 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CD8B2-202ENST00000417670 633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL365277.1-206ENST00000417869 487 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC01806-201ENST00000436506 765 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL365277.1-204ENST00000450157 599 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AL365277.1-203ENST00000458207 693 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CENPM-208ENST00000472374 541 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NME2-207ENST00000514264 850 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC109479.1-201ENST00000519603 624 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C19orf70-204ENST00000587950 655 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LONRF3-201ENST00000304778 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC02228-204ENST00000642115 2962 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PLTP-205ENST00000477313 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NDUFS2-201ENST00000367993 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 P3H2-AS1-201ENST00000412203 730 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 YBX1P6-201ENST00000442962 1002 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AP002992.1-201ENST00000527519 491 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 IL32-222ENST00000533097 814 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TSG101-204ENST00000536719 2101 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC023310.1-201ENST00000554836 735 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC009134.1-201ENST00000571939 443 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TBC1D16-205ENST00000572862 1141 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C2orf54-202ENST00000388934 1911 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 FUT7-201ENST00000314412 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PPP1R15A-201ENST00000200453 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 CERS6-201ENST00000305747 7217 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MFF-204ENST00000353339 2186 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NSUN5P1-204ENST00000428392 1562 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ACTBP8-201ENST00000403258 1108 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 BCYRN1-201ENST00000418539 200 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RBM24-203ENST00000425446 1034 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 STAG3L5P-205ENST00000473757 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC120057.1-201ENST00000483947 663 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC106786.2-201ENST00000506859 561 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 NME2-206ENST00000513177 692 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PACS1-203ENST00000524815 628 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SLC35A1-202ENST00000369556 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 SQSTM1-213ENST00000510187 1714 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
SOBPA7XYQ1 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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