Protein–RNA interactions for Protein: A6NFT4

CFAP73, Cilia- and flagella-associated protein 73, humanhuman

Predictions only

Length 308 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CFAP73A6NFT4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DNAJC16-201ENST00000375838 2357 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 APBA1-201ENST00000265381 6534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GALNT3-201ENST00000392701 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CORO7-222ENST00000574025 2826 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 OFD1-204ENST00000398395 3307 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DSEL-201ENST00000310045 9531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DMTN-214ENST00000519907 2658 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AGPAT3-218ENST00000546158 2199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GRK6-211ENST00000528793 2571 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FRMD3-201ENST00000304195 5297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SERPINA4-203ENST00000557004 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 RAB43-202ENST00000393304 4230 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 IMPDH1-204ENST00000419067 2431 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 LRP8-201ENST00000306052 7648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SNPH-202ENST00000381873 4995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SMTN-223ENST00000619644 3227 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 SPRY2-201ENST00000377102 2708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PTGES3L-AARSD1-204ENST00000421990 2150 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DDX19B-207ENST00000563206 1765 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 CSNK1A1P1-201ENST00000430593 2147 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 FAM120A-202ENST00000375389 3585 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AQP12A-202ENST00000429564 1110 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 PAWRP1-201ENST00000451083 565 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
CFAP73A6NFT4 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MAD1L1-204ENST00000406869 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 NUP54-217ENST00000514987 1563 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 RPGRIP1-210ENST00000556336 2955 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 NUTM2A-202ENST00000381707 3290 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 NUTM2B-203ENST00000429828 3292 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 THUMPD3-AS1-202ENST00000468186 3253 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 AC099521.3-201ENST00000624251 2938 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SEZ6L-202ENST00000343706 2898 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 COQ8A-203ENST00000366779 5523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HVCN1-202ENST00000356742 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 Z98749.3-201ENST00000400206 1770 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FGR-202ENST00000374004 2350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MFSD11-211ENST00000588460 3612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 HNRNPH1-203ENST00000393432 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 TFR2-201ENST00000223051 2888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 FUNDC2-201ENST00000369498 6455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 PGLYRP2-201ENST00000292609 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 COL6A4P2-202ENST00000504443 2753 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
CFAP73A6NFT4 SLC2A9-202ENST00000309065 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms