Protein–RNA interactions for Protein: A2RU54

HMX2, Homeobox protein HMX2, humanhuman

Predictions only

Length 273 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HMX2A2RU54 ROPN1-203ENST00000459660 1909 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GJD2-201ENST00000290374 2889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GOLGA8H-201ENST00000566740 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GOLGA8J-201ENST00000567927 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FBXL19-202ENST00000380310 3796 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC22A6-204ENST00000458333 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ALDOA-228ENST00000627059 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MALSU1-202ENST00000466681 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MGMT-201ENST00000306010 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 STK40-204ENST00000373132 3621 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PLD3-201ENST00000356508 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC097359.2-201ENST00000604992 2389 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 FSIP1-201ENST00000350221 2805 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PRUNE2-202ENST00000376713 1069 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 IRF3-204ENST00000442265 315 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LINC01128-208ENST00000608189 824 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ACHE-202ENST00000302913 2956 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MAP2K7-201ENST00000397979 3361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 REXO1L4P-201ENST00000605109 1937 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LPAR5-201ENST00000329858 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RPL15-201ENST00000307839 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 LRCOL1-201ENST00000376608 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GPR162-202ENST00000382315 1150 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CNOT8-210ENST00000519404 945 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CNOT8-214ENST00000520671 923 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 CNOT8-218ENST00000521583 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 MIR4453-201ENST00000584019 89 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 PRMT9-201ENST00000322396 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 C17orf80-203ENST00000359042 3645 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 AL035456.1-201ENST00000456064 1369 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
HMX2A2RU54 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 HIST1H2AG-201ENST00000359193 2250 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 RNPS1-216ENST00000565678 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 TRIM3-215ENST00000639856 2137 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
HMX2A2RU54 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64.8 ms