Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5L0

TNPO3, Transportin-3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 923 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MALAT1-213ENST00000618227 593 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DNAJC5-201ENST00000360864 5213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CETN4P-206ENST00000642099 2168 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EPHX2-209ENST00000521780 2038 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PPL-205ENST00000590782 5845 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC092718.8-201ENST00000640345 2892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LINC01264-201ENST00000431395 500 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AKR1E2-212ENST00000532248 844 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC004803.1-204ENST00000543290 512 ntTSL 4 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL589739.1-201ENST00000607720 493 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LINC00623-201ENST00000613486 486 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 COX11-201ENST00000299335 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC084364.1-201ENST00000551967 1556 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CRH-201ENST00000276571 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ARHGAP23-221ENST00000620417 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA8-204ENST00000535454 2112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ZNF593-201ENST00000270812 698 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PAM16-201ENST00000318059 587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM205-201ENST00000354882 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM205-205ENST00000586590 677 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TMEM205-207ENST00000586956 1003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ARHGEF28-202ENST00000296799 4424 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 NUTM2D-202ENST00000412718 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 CEACAM16-201ENST00000405314 1583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 C16orf54-201ENST00000329410 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SLC4A3-202ENST00000317151 4069 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 SIGLEC8-203ENST00000430817 1528 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
TNPO3Q9Y5L0 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms